在自体干细胞移植的过程中，可能会混有少量的肿瘤细胞，这些细胞可能会导致肿瘤复发。并且自体干细胞移植不适合遗传性疾病，如地中海贫血，同时也不适合本身造血干细胞就存在异常情况的患者，如患有再生障碍性贫血的患者。

自体干细胞移植就是把患者自己的骨髓或者外周血当中的干细胞提取出来，然后在患者化疗或放疗以后进行回输，让这些干细胞重建患者的造血系统和免疫系统。

通俗地说，就是把患者自己的造血干细胞保存起来，在患者需要的时候再给患者输入回去，以达到治疗的目的。所以，自体干细胞移植是一种治疗方法，而不是一种检查方法。