肺病毒感染后的细菌易感性难题已困扰人们超过一个世纪，治疗方案也没有真正改变，主要是抗生素的引入。众所周知，长期抑制先天免疫机制发生在严重的急性或慢性炎症之后；在严重病毒感染后很长时间内，免疫机制会重新设置各种免疫细胞的炎症“音调”，现被称为训练免疫、先天印记或免疫麻痹。
病毒感染对其他气道天然免疫细胞的影响
(一) 调节性T细胞和TGF-β
流感感染后IL-10会增强，并通过抑制免疫促进病毒感染肺中的细菌复制，这一过程可能由吲哚胺2，3-双加氧酶（IDO）上调驱动。此外，调节性T细胞和TGF-β在病毒感染后升高，以抑制炎症和促进伤口修复过程，例如通过诱导胶原合成。最近的一项研究表明，β6整合素可阻止激活TGF-β，从而导致气道巨噬细胞的存在。
(二)白细胞介素-13
在人肺组织和BAL中也发现了类似的Lin-CD127+ST2+CRTH2+ILC2s群体，并已知可产生IL-13。在小鼠试验中，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌在流感病毒感染后3天内可诱导IL-13，并可杀伤和清除病毒。
(三) 先天淋巴样细胞
在流感病毒感染期间，第2型先天淋巴样细胞（ILCs）会增加，并分泌IL-13，虽然对伤口修复很重要，但在细菌感染期间并没有用。总的来说，这些研究表明ILC2s可以是有益的或有害的，这取决于动力学。
(四) NK细胞
早期的病毒感染，会诱导NK细胞会聚集到肺部，它们通过释放细胞因子来促进抗病毒免疫细胞，去除具有下调MHCI类的感染细胞来限制病毒复制。如果NK细胞被耗尽，可能会导致长期病毒感染。
(五)自然杀伤T细胞
白细胞介素-10被病毒感染会上升，并通过抑制肺单核细胞衍生的树突状细胞产生白细胞介素-12来抑制不变的自然杀伤T（INKT）细胞，这有助于肺炎球菌的生长。
(六) γδT细胞
在继发性细菌感染的易感性中，γδT细胞也很重要。这些罕见的T细胞可以直接识别病原体相关分子模式（PAMPs），表达一系列具有调节功能的细胞因子受体，通过FAS和TRAIL介导细胞裂解，并释放抗菌肽和细胞毒性分子。它们还产生干扰素-γ、TNF-α和IL-17。在病毒感染期间，肺部炎症程度作用取决于是否存在其他潜在条件。
(七) 粘膜相关不变T细胞
粘膜相关不变T（MAIT）细胞是一个最近研究的群体，在粘膜组织中具有重要的抗菌免疫作用。它们通过IL-12和IL-7的协同作用表达细胞毒性标记物，如CD107a和颗粒酶B，并产生IFN-γ、TNF-α和IL-17A，它们在肺中的作用开始显现。外周血CD161（+）Vα7和2（+）MAIT细胞与禽H7N9流感住院患者的死亡有关。然而，目前尚不清楚这一群体的缺陷是否会使细菌在肺部易受感染。
气道的伤口修复和细菌敏感性
(一) 高危人群
老年人、哮喘患者、孕妇等是已知的“高危”患者群体。而且冬季为该疾病的高发期。“面临风险”的群体在此之外，也有其他的特征人群。例如，在情绪低落、压力、焦虑或心理健康问题的人中，细菌性肺炎增多。
(二)病毒感染的恢复和细菌生长
粘膜屏障的破坏不能解释所有的感染性并发症。在病毒感染的恢复和细菌生长期间有一个机会窗口，在这里先天免疫可以被启动更快的反应速度。这可能涉及去除免疫抑制途径（CD200R、IL-10和TGF-β）、促进凋亡细胞清除（因为凋亡细胞识别受体关闭先天免疫）或及时从气道中去除高分子量基质成分。为了确定这些，需要我们需要不断进行研究，也要考虑到其他共患病、心理健康状况和多药对结果的影响。
(三) 抑郁和压力
丹麦分别对976人，398人进行的一项基于人群的研究（其中976人中有142人有抑郁史，398人中169人有抑郁史），经研究发现，抑郁症的发病与呼吸病毒或细菌并发症的增加有关（IRR=1。58；CI=1。36-1。85；p=0。000）。抑郁，压力是造成抑制先天免疫和适应性免疫的因素之一，细菌清除中性粒细胞也包含在主要因素之中。在加拿大因肺炎住院的老年患者中，45%的人在入院前服用了5种或更多的药物，这些药物可能会调节免疫系统，目前，这一领域的研究较少。
除了减少中性粒细胞趋化剂外，肺被病毒感染后可能倾向于伤口修复。介导伤口修复的分子往往具有免疫抑制作用。
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